El Ayuntamiento najerino ha aprobado en pleno y por unanimidad de todos los grupos políticos el diseño de la enseña de la ciuda.

Su simbología es así: En el cuarterón superior del asta de la bandera se aprecia corona real abierta por ser cuna, sede y panteón real como Reino de Nájera, distintivo y privilegio de la ciudad que sólo se permite a la ciudad según la ciencia de la banderas o vexilología. En el cuarterón del batiente apreciamos la Jarra de Azucenas o Lirios que rememoran la Orden de la Terraza o de la Jarra, primera orden de caballería conocida de Europa. Jarra en oro y azucenas o lirios que simbolizan también el Monasterio y la patrona Santa María La Real. Bandera de fondo rojo, colores tradicionales de Navarra y Castilla. Cruz en azul celeste por el río al que da nombre la ciudad, el Najerilla y sus afluentes. Cruz de encrucijada de caminos que trajo Sancho III El Mayor, desviando el Camino de Santiago, consolidando Nájera como ruta jacobea. Cruz también en astil que era el símbolo de ostentación medieval de capital y cuna de reyes (cruz sobre un asta de madera). Cruz del primer reino de la reconquista que pretendió la unidad con el rey Sancho III El Mayor o El Grande de todos los reinos cristianos uniendo en uno sólo a Castilla, Nájera-Pamplona y Aragón.